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水族箱使用的过滤设备有许多种， 按安放的位置分为：上部式、底部式、内置式、外置式、下置式，按过滤形式又分为：单一式、组合式、滴流式、溢流式、干湿式，按功能又有：传统式、流砂床式、蛋白质分离器、去硝过滤器、钙反应器、臭氧发生器、紫外线杀菌器、冷热机等。
底部过滤器
这种过滤器人部分是自制的。将带有布满孔隙的塑料管围成闭合的管道网，在一端没有竖直的水管，能将水引出到水族箱团，在闭合的管道网上面铺设一块漏水板，在漏水板上面再铺一层尼龙网，在尼龙网上方铺满厚为5公分～10公分的细粒珊瑚砂做为过滤材质。漏水板目的是使底部充满水的空间不致被珊瑚砂填满影响过滤的效果，绝不能为了省事而放弃这层漏水板。尼龙网的目的也是为了防止珊瑚砂漏到漏水板下面的空间，抽水的办法可以直接使用水泵也可以使用空气杨液泵。这种过滤器的优点是过滤面积大，仅仅使用珊瑚砂，所以较为经济。但由于珊瑚砂层不可太厚，而且易于形成板结死角，清洗也较困难，饲养量不能太多，有些鱼还喜欢挖洞穴，使尼龙网和漏水板暴露造成水流的“短路”现象。所以底部过滤器是一种低效率的过滤系统，很少单独使用，有时为了造景及增加对底部的珊瑚砂的处理偶而也有加用底部过滤器。
上部式过滤器
它是安放在水族箱上面的一种过滤器，利用水泵将水族箱中的水抽至过滤器的一端，进入过滤器中的水即沿着过滤器通过滤材最后到达另端，由底部口落入水族箱中，形成循环。由于此种过滤器的深度不高，容积很小水似乎没有什么压力，要求滤材有极好的通透性，否则易于堵塞。由于容积小，过滤能力有限，所以水族箱中饲养的鱼儿不能多，更不能饲养软体动物。在使用时一定要配以蛋白质分离器。为了增加它的容量可以使用组合式上部过滤器，其中增加了一个滴流小盒，生物滤材的量也加人了，使水质显著地改善，在海水水族箱中用上部过滤器都考虑增加滴流盒。
外置过滤器
为解决上部及底部过滤器缺点，外置式过滤器是采用外置一个密封罐，罐内装有高质量的滤材，又安装一个内藏式的水泵对罐内的水施加一定的压力，进、出水均用软管与水族箱内的海水相连。它的特点是效率高不占水族箱内的有限空间。滤材清洗与更换方便，并且可以多个串接使用。缺点是造价很高，而且滤材多数是浸泡在水中，降低了生物过滤的效率。近年EHEIM公司推出一种罐式干湿过滤器较好的解决了这个问题，但造价更高，使用这类的过滤器最好增加一个小型的表面过滤器以滤除在水表面漂浮的油膜。
下部过滤器(溢流式过滤器)
这是置于水族箱支架下面的过滤器，由图4—5所示。上下的连结是通过二根管子， 一根是穿过水族箱的底部直插在过滤器中，当水族箱中的水面超过管子的顶部时就会通过管子溢流到下部过滤器中，下部过滤器可以设有滴流式过滤及各种机械、生物、吸附过滤。经过过滤的水再由水泵提升到上面的水族箱中形成循环。由于进水口及出水口的位置较高，在停电时不会发生倒流现象。为了改善水族箱中水对流的程度，在溢流管外套一个口径稍大的外管，在外管上增加中部及下部的出水孔，只要顶端有水流动，根据流体力学原理定会带动中部及下部出水孔处的水进入内、外管夹层汇同顶端流动的水一齐进入溢水管落向下部滤水槽中，在进水管处也加有二个进水孔，一个小孔在水面上边，另一个在中部，由于泵提升上来的水可以在上、中、下三个部位进入水族箱内、结合出水管也是在三个部位出水，因此整个水族箱中的水得到了很好的循环。包括表面的油膜也都会被吸入到下部的过滤槽去。进水管在水面上边的一小孔，在正常进水时有水喷入到水族箱中，亦具有增氧效果。一旦发生停电，水泵停止运转，由于虹吸发牛，水将会发生倒灌，当上面的小孔位于空气中，空气被吸入管中，虹吸即被破坏，使到水不能再经过进水管流动，而出水管也不能流水，整个水族箱内的水就被保持在原来的位置上而不会倒流人下部的过滤槽中。
滴流式过滤器
滴流式过滤器是将塑料割成的多页片式的生化球置于上端开口的容器内，在底部有一个水泵。污水由七面淋入容器内，生化球并非浸泡在水中，而是裸露在空气中，当污水由上面进入容器内，沿着生化球表面流至容器底部然后由水泵抽走。由于生化球是裸露在窄气中的，故氧气的供应是不成问题的。污水沿生化球表面流过源源不断的为附着在其表面上的硝化细菌提供丰富的营养盐(污垢中含有的氮化合物)。因此硝化细菌十分活跃，硝化反应十分的强烈。一旦发生动力停止运转，水流停止，因为生化球是裸露于空气中，氧气仍然是相当的充足，既使暂时缺少了硝化细菌生长所必须的营养盐，硝化细菌也仍然可以存活2天～3天。当动力恢复水流又重新流经生化球，硝化细菌又立即吸收营养盐硝化工作又正常进行了。只要生化球表面不干涸保持一定的湿度，硝化细菌就不会死，这是滴流式过滤器的最大优点。流水不断流经生化球不断的冲刷生化球表面，将已老化死亡的菌冲到容器的底层，使新的菌层迅速生长，使硝化作用一直保持着很高的效率。
生化球永远不必清洗更换，这也是滴流式过滤器另一大优点。生化球使用的体积约为水族箱水体的5％～10％即可。为了提高生化球的过滤效果在过滤容器的顶部可以增加一个预过滤器，放置海绵将大块的污垢如大颗粒饲料、大块的排泄物粘状物及可能存在的尸体都隔在海绵上。为r增加容器内氧气也可以在底部设一个空气扩散器(气头)，使上升的气流与下降的水流相撞击。使硝化细菌获得更多的氧。
干湿呼吸式过滤器
在滴流式过滤器中，水自上而下凭借重力流经生化球表面，相瓦之间接触的时间很短，有些生化反应还来不及进行，干湿呼吸式过滤器大大的改善了这种状况。它是一种简单的装置可以使水在容器中周期性改变水位高度，从而容器中滤材也周期性的浸泡与裸露在窄气中，在这过程中即获得了充足的氧气也延长水与滤材接触的时间，还增强了水对滤材的切向冲击力。加强了滤材上硝化细菌的代谢能力。干湿呼吸式过滤器还扩大了滤材的使用范围。除了牛化球，多孔玻璃陶瓷环外，生化棉、尼龙丝球、吸氨石(沸石)火山岩等都可以应用在干湿呼吸式过滤器中。它的生化过滤效率是滴流式过滤器的3倍。是浸泡式过滤器的数倍。
德国EHEIM公司生产的一种干湿呼吸式过滤简，它的呼吸原理是利用浮子原理。我们生产的干湿呼吸器利用虹吸原理使用范围广，呼吸深度大，从几个厘米到几米高的深度都可以进行呼吸。小到普通上部过滤器，只要将吸收器插在出水口处即可将上部过滤器改成干湿式过滤器。在大规模养殖及在销售的店铺中使用干湿呼吸过滤器不仅改善了水质提高了成活率，而且还节省了许多过滤系统所占用的空间。
流砂床过滤器
流砂床过滤器又叫流砂过滤器，是在一个密闭的容器内装有一定量的细砂，污水由中心管深入底部然后由底部进入容器，将细砂从底部翻起不停的翻滚，人块的污垢被细砂磨碎。
由于细砂间不断的滚动摩擦加速了细砂表面硝化细菌的新陈代谢大大提高了硝化的效率，有很强的分解污垢的能力。它不会在容器内产生死角与短路现象。细砂也不必进行清洗，它的体积很小，效率却很高。 (图4—9)如果能给适当的增氧，它的效果会进一步提升。在实际的使用时最好能配以适当的生物过滤，效果会更好。
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